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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein PSA2A_ARATH and isoform O23708-2

Template: 1iru
Sequence Identity (Template - Swissprot): 0.65665233
Coverage of swissprot protein: 0.99148935

Alignment

PSA2A_ARATH	MGDSQYSFSLTTFSPSGKLVQIEHALTAVGSGQTSLGIKASNGVVIATEKKLPSILVDEASVQKIQHLTPNIGVVYSGMGPDFRVLVRKSRKQAEQYLRL
1iru		-AERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGPDYRVLVHRARKLAQQYYLV
SSE		-CCCCCCCECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCECCCCCCCCEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS

PSA2A_ARATH	YKEPIPVTQLVRETATVMQEFTQSGGVRPFGVSLLVAGYDDKGPQLYQVDPSGSYFSWKASAMGKNVSNAKTFLEKRYTEDMELDDAIHTAILTLKEGFE
1iru		YQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFE
SSE		HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCECECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEECEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
VARSPLIC	SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                    

PSA2A_ARATH	GEISSKNIEIGKIGADKVFRVLTPAEIDDYLAEVE
1iru		GQMTEDNIEVG-ICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA
SSE		CCCCCCCEEEE-EEECCEEEECCHHHHHHHHCCCC
VARSPLIC

Varsplic events:
VSP_016142 REPLACE 1-148 MGDSQYSFSLTTFSPSGKLVQIEHALTAVGSGQTSLGIKASNGVVIATEKKLPSILVDEASVQKIQHLTPNIGVVYSGMGPDFRVLVRKSRKQAEQYLRLYKEPIPVTQLVRETATVMQEFTQSGGVRPFGVSLLVAGYDDKGPQLYQ => MIIPVRCFTCGK, affected aminoacids in template: 0-146 Color: Pink

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