print

Sprachauswahl

Benutzermenü

Navigationspfad

Hauptnavigation

Inhalt

Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein FUM2_ARATH and isoform Q9FI53-2

Template: 1yfm
Sequence Identity (Template - Swissprot): 0.7104677
Coverage of swissprot protein: 0.8997996

Alignment

FUM2_ARATH	MAALTMQFEGEKKNVSEVADVTLKQEDEQQERRSYSTPFREERDTFGPIQVPSDKLWGAQTQRSLQNFEIGGDRERMPEPIVRAFGVLKKCAAKVNMEYG
1yfm		-------------------------------------SFRTETDAFGEIHVPADKYWGAQTQRSFQNFKIGGARERMPLPLVHAFGVLKKSAAIVNESLG
SSE		-------------------------------------CEEEECCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VARSPLIC	                                                                                                    

FUM2_ARATH	-LDPMIGEAIMEAAQEVAEGKLNDHFPLVVWQTGSGTQSNMNANEVIANRAAEILGHKRGEKIVHPNDHVNRSQSSNDTFPTVMHIAAATEITSRLIPSL
1yfm		GLDPKISKAIQQAADEVASGKLDDHFPLVVFQTGSGTQSNMNANEVISNRAIEI---------VHPNNHCNQSQSSNDTFPTVMHIAASLQIQNELIPEL
SSE		CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC---------CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

FUM2_ARATH	KNLHSSLESKSFEFKDIVKIGRTHTQDATPLTLGQEFGGYATQVEYGLNRVACTLPRIYQLAQGGTAVGTGLNTKKGFDVKIAAAVAEETNLPFVTAENK
1yfm		TNLKNALEAKSKEFDHIVKIGRTHLQDATPLTLGQEFSGYVQQVENGIQRVAHSLKTLSFLAQGGTAVGTGLNTKPGFDVKIAEQISKETGLKFQTAPNR
SSE		HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCH
VARSPLIC	                                                                                                    

FUM2_ARATH	FEALAAHDACVETSGSLNTIATSLMKIANDIRFLGSGPRCGLGELSLPENEPGSSIMPGKVNPTQCEALTMVCAQVMGNHVAVTIGGSNGHFELNVFKPV
1yfm		FEALAAHDAIVECSGALNTLACSLFKIAQDIRYLGSGPRCGYHELMLPENEPGSSIMPGKVNPTQNEALTQVCVQVMGNNAAITFAGSQGQFELNVFKPV
SSE		HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCECCECCCHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

FUM2_ARATH	IASALLHSIRLIADASASFEKNCVRGIEANRERISKLLHESLMLVTSLNPKIGYDNAAAVAKRAHKEGCTLKHAAMKLGVLTSEEFDTLVVPEKMIGPSD
1yfm		MIANLLNSIRLITDAAYSFRVHCVEGIKANEPRIHELLTKSLMLVTALNPKIGYDAASKVAKNAHKKGITLKESALELGVLTEKEFDEWVVPEHML----
SSE		HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCEECHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHCC----
VARSPLIC	                                                                        IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    


Varsplic events:
VSP_011355 REPLACE 472-499 HAAMKLGVLTSEEFDTLVVPEKMIGPSD => VNNKLLTFSSLNKSEFKPIFSKRKHVHVCYNIFVVLFWI, affected aminoacids in template: 426-449 Color: Yellow



Servicebereich

Fußzeile