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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein LYPA1_MOUSE and isoform P97823-2

Template: 1fj2
Sequence Identity (Template - Swissprot): 0.8995633
Coverage of swissprot protein: 0.9956522

Alignment

LYPA1_MOUSE	MCGNNMSAPMPAVVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEAFAGIKSPHIKYICPHAPVMPVTLNMNMAMPSWFDIVGLSPDSQEDESGIKQAAETVKALI
1fj2		MDPEFMSTPLPAIVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEAFAGIRSSHIKYICPHAPVRPVTLNMNVAMPSWFDIIGLSPDSQEDESGIKQAAENIKALI
SSE		CCCHHHCCCCCEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEHHHCCEEEECCCCECCCCCCCCECHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

LYPA1_MOUSE	DQEVKNGIPSNRIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVTALSCWLPLRASFSQGPINSANRDISVLQCHGDCDPLVPLMFGSLTVERLKALINPANVTF
1fj2		DQEVKNGIPSNRIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVTALSCWLPLRASFPQGPIGGANRDISILQCHGDCDPLVPLMFGSLTVEKLKTLVNPANVTF
SSE		HHHHHCCCCHHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEE
VARSPLIC	                                                                                                    

LYPA1_MOUSE	KIYEGMMHSSCQQEMMDVKHFIDKLLPPID
1fj2		KTYEGMMHSSCQQEMMDVKQFIDKLLPPI-
SSE		EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC-
VARSPLIC	             SSSSSSSSSSSSSSSS

Varsplic events:
VSP_009197 REPLACE 214-230 EMMDVKHFIDKLLPPID => VGVSGSSE, affected aminoacids in template: 213-228 Color: Pink

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