Proseminar Algorithmen der Bioinformatik (WS 2007/08)

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Aktuelle Hinweise

Beginn des Proseminars ist wieder um 12ct.

Allgemeine Informationen

Leitung:

Simon W. Ginzinger

Volker Heun

Zeit und Ort:

12ct-14

Amalienstr. 17, SR 107

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

16.10.:	Volker Heun Einführungsveranstaltung Folien (Download freischalten)
30.10.:	Thema 1,3,4: Kurzvorträge
06.11.:	Thema 2,8,9,11: Kurzvorträge
20.11.:	Battal Ates Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Simon W. Ginzinger Vorbesprechung: 06.11.
27.11.:	abgesagt Thema (2): String Matching: Karp-Rabin Betreuer: Simon W. Ginzinger Vorbesprechung: 13.11.
04.12.:	Damir Spahic Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 20.11.
11.12.:	Philipp Dziuk Thema (4): Textcompression: Burrow-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 27.11.
18.12.	Bernd Ahlborn Thema (8): Structural Alignment Betreuer: Simon W. Ginzinger Vorbesprechung: 04.12.
12/07,01/08:	Weihnachten/Neujahr/Heilige Drei Könige
15.01.:	Maximilian Miller Thema (9): Partial Digest Problem Betreuer: Simon W. Ginzinger Vorbesprechung:18.12.
22.01.:	Denis Krompass Thema (11): Genome Rearrangements Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 08.01.
29.01.:	Abschlussbesprechung
05.02.:	Fasching

Literatur

Detaillierte Themenliste als PDF mit Literaturangaben.

Hinweise

Allgemeine Hinweise zu Seminaren
Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik)
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt). Ein Online-Kochbuch zu LaTeX ist ebenfalls verfügbar.

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