Proseminar Bioinformatik: Algorithmische Bioinformatik (SS 2014)

Aktuelle Hinweise

Die Vortragstermine und Vorbesprechungstermine stehen jetzt fest. Teilweise werden letztere 3 Wochen vor dem Vortragstermin stattfinden.

Allgemeine Informationen

Dozent:

Volker Heun
Benjamin Albrecht

Zeit und Ort:

12-14

Amalienstr. 17, A107

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

07.04.14	Volker Heun Einführungsveranstaltung Folien (Download freischalten)
21.04.14	Ostern
28.04.14	entfällt Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 07.04.14
05.05.14	Daniel Schmitz Thema (2): String Matching: Shift-And and Karp-Rabin Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 14.04.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
12.05.14	Nathalie Gerstner Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 28.04.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
19.05.14	Guido Kubach Thema (4): Textcompression: Burrows-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 05.05.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
26.05.14	Valentin Passon Thema (5): Suffix Arrays and BWT Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 12.05.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
02.06.14	Katharina Schmid Thema (6): Algorithmic Concepts for Sequence Alignment Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung:19.05.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
09.06.14	Pfingsten
16.06.14	Nicola Palandt Thema (7): Sequence Assembly Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 26.05.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
23.06.14	entfällt Thema (8): Genome Rearrangements Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 02.06.14
30.06.11	Madox Sesen Thema (9): Evolutionary Trees Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 16.06.14 Ausarbeitung (Download freischalten)
30.06.14 ca. 14st	Benjamin Ölke Thema (10): RNA Structure Prediction Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 16.06.14
07.07.14	Abschlussbesprechung

Literatur

Detaillierte Themenliste mit Literaturangaben

Hinweise

Allgemeine Hinweise des Veranstaltungsleiters zu Seminaren. Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik).
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt).

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