Proseminar Bioinformatik (SS 2009)

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Aktuelle Hinweise

Die Vorbesprechungstermine zu den einzelnen Vorträgen stehen jetzt fest.
Ab Montag, den 29. Juni findet das Proseminar wieder im Seminarraum 107 in der Amalienstr. 17 statt. statt.

Allgemeine Informationen

Dozent:

Volker Heun

Zeit und Ort:

12-14

Amalienstr. 17, A107
Theresienstr. 39, B132

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

20.04.	Volker Heun Einführungsveranstaltung Folien (Download freischalten)
27.04.	Luca Virginia-Cezara Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 14.04. (14:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
04.05.	Michael Kluge Thema (2): String Matching: Shift-And and Karp-Rabin Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 20.04 (11:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
11.05.	Shen Wei Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 27.04. (nach dem Proseminar) Ausarbeitung (Download freischalten)
18.05.	Julia Rackerseder Thema (4): Textcompression: Burrow-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 04.05. (11:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
25.05.	Simon Domke Thema (5): Algorithmic Concepts for Sequence Alignment Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 11.05. (11:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
01.06.	Pfingsten
08.06.	Uwe Altermann Thema (6): Algorithmic Concepts for Searching in Biological Databases Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 18.05. (nach dem Proseminar) Ausarbeitung (Download freischalten)
15.06.	Lisa Velden Thema (7): Partial Digest Problem Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 25.05. (11:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
22.06.	Jonathan Boidol Thema (8): Sequence Assembly Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 08.06. (11:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
29.06.	Julia Schechter Thema (9): Genome Rearrangements Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 15.06. (11:00) Ausarbeitung (Download freischalten)
06.07	Kieu Trinh Do Thema (10): Evolutionary Trees Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 22.06. (nach dem Proseminar) Ausarbeitung (Download freischalten)
13.07.	Sebastian Hollizeck Thema (11): RNA Structure Prediction Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 29.06. (11:00)
20.07.	Abschlussbesprechung

Literatur

Detaillierte Themenliste mit Literaturangaben

Hinweise

Allgemeine Hinweise des Veranstaltungsleiters zu Seminaren. Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik).
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt). Ein Online-Kochbuch zu LaTeX ist ebenfalls verfügbar.

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