Proseminar Bioinformatik (WS 2010/11)

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Aktuelle Hinweise

Die Vorbesprechungstermine stehen jetzt fest.

Allgemeine Informationen

Dozent:

Volker Heun

Zeit und Ort:

12-14

Amalienstr. 17, A105

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

18.10.	Volker Heun Einführungsveranstaltung Folien (Download freischalten)
25.10.	Sonja Waldraff Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 11.10.10, 11 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
01.11:	Allerheiligen
08.11.	Maria Kalemanova Thema (2): String Matching: Shift-And and Karp-Rabin Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 19.10.10, 13:00 Ausarbeitung (Download freischalten)
15.11.	Valerio Lupperger Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 26.10.10, 16:00 Ausarbeitung (Download freischalten)
22.11.	Hans Hawe Thema (4): Textcompression: Burrow-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 09.11.10, 16 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
29.11.	Simon Dirmeier Thema (5): Suffix Arrays and BWT Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 15.11.10, nach dem Proseminar Ausarbeitung (Download freischalten)
06.12.	Katharina Hembach Thema (6): Algorithmic Concepts for Sequence Alignment Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 23.11.10, 16 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
13.12.	Karolina Worf Thema (7): Partial Digest Problem Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 29.11.10, nach dem Proseminar Ausarbeitung (Download freischalten)
20.12.	Gudrun Idrissou Thema (8): Sequence Assembly Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 06.12.10, nach dem Proseminar Ausarbeitung (Download freischalten)
12/10, 01/11:	Weihnachten/Neujahr/Heilige Drei Könige
17.01.	Valentina Klaus Thema (9): Genome Rearrangements Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 14.12.10, 16 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
24.01.	Julia Gerke Thema (10): Evolutionary Trees Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 20.12.10, nach dem Proseminar Ausarbeitung (Download freischalten)
31.01.	Kinga Balazs Thema (11): RNA Structure Prediction Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 18.01.11, 16 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
07.02.	Abschlussbesprechung

Literatur

Detaillierte Themenliste mit Literaturangaben

Hinweise

Allgemeine Hinweise des Veranstaltungsleiters zu Seminaren. Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik).
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt). Ein Online-Kochbuch zu LaTeX ist ebenfalls verfügbar.

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